Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 MED24-204ENST00000394128 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 GAS8-201ENST00000268699 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 DLL1-201ENST00000366756 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 GPD1-201ENST00000301149 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 GSTM3-201ENST00000256594 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 OFD1-203ENST00000380567 3736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 C22orf39-202ENST00000399562 3350 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 ALDH1L1-202ENST00000393431 2797 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 AC015712.2-201ENST00000560351 3688 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 AC010969.2-201ENST00000602458 3231 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 POMT1-203ENST00000372228 3123 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 UBTFL8-201ENST00000426903 2112 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 MDGA1-207ENST00000505425 3021 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 INPP5J-201ENST00000331075 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 HERC6-202ENST00000273960 3473 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 LITAF-221ENST00000622633 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 TBX3-201ENST00000257566 4208 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms