Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.7 ms