Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP2

SLC12A9, Solute carrier family 12 member 9, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A9Q9BXP2 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC12A9Q9BXP2 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms