Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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C9orf16Q9BUW7 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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C9orf16Q9BUW7 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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C9orf16Q9BUW7 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
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