Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms