Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 AP002336.2-201ENST00000528607 539 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms