Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

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Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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