Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms