Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms