Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC10.68□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC10.67□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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