Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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RABGGTAQ92696 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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RABGGTAQ92696 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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RABGGTAQ92696 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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RABGGTAQ92696 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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RABGGTAQ92696 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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RABGGTAQ92696 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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RABGGTAQ92696 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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RABGGTAQ92696 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
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