Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms