Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
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ZNF548Q8NEK5 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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