Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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ZNF248Q8NDW4 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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