Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRRC17Q8N6Y2 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRRC17Q8N6Y2 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms