Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYNE4Q8N205 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYNE4Q8N205 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYNE4Q8N205 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYNE4Q8N205 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYNE4Q8N205 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYNE4Q8N205 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYNE4Q8N205 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYNE4Q8N205 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYNE4Q8N205 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYNE4Q8N205 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYNE4Q8N205 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNE4Q8N205 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNE4Q8N205 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNE4Q8N205 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNE4Q8N205 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNE4Q8N205 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNE4Q8N205 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNE4Q8N205 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNE4Q8N205 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNE4Q8N205 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNE4Q8N205 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNE4Q8N205 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNE4Q8N205 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNE4Q8N205 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNE4Q8N205 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNE4Q8N205 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNE4Q8N205 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNE4Q8N205 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNE4Q8N205 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNE4Q8N205 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNE4Q8N205 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNE4Q8N205 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNE4Q8N205 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNE4Q8N205 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNE4Q8N205 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNE4Q8N205 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNE4Q8N205 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNE4Q8N205 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNE4Q8N205 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNE4Q8N205 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNE4Q8N205 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNE4Q8N205 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNE4Q8N205 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNE4Q8N205 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNE4Q8N205 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNE4Q8N205 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNE4Q8N205 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNE4Q8N205 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNE4Q8N205 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNE4Q8N205 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNE4Q8N205 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNE4Q8N205 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNE4Q8N205 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNE4Q8N205 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNE4Q8N205 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNE4Q8N205 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNE4Q8N205 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNE4Q8N205 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNE4Q8N205 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNE4Q8N205 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNE4Q8N205 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNE4Q8N205 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SYNE4Q8N205 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SYNE4Q8N205 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SYNE4Q8N205 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SYNE4Q8N205 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
SYNE4Q8N205 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNE4Q8N205 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNE4Q8N205 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNE4Q8N205 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNE4Q8N205 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNE4Q8N205 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNE4Q8N205 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNE4Q8N205 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNE4Q8N205 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNE4Q8N205 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNE4Q8N205 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNE4Q8N205 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNE4Q8N205 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNE4Q8N205 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNE4Q8N205 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNE4Q8N205 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNE4Q8N205 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNE4Q8N205 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNE4Q8N205 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNE4Q8N205 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNE4Q8N205 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNE4Q8N205 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNE4Q8N205 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNE4Q8N205 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNE4Q8N205 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNE4Q8N205 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNE4Q8N205 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNE4Q8N205 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNE4Q8N205 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNE4Q8N205 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNE4Q8N205 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNE4Q8N205 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNE4Q8N205 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms