Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U2

TMEM61, Transmembrane protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM61Q8N0U2 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM61Q8N0U2 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms