Protein–RNA interactions for Protein: Q86XE0

SNX32, Sorting nexin-32, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX32Q86XE0 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX32Q86XE0 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms