Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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