Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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TRAPPC6BQ86SZ2 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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TRAPPC6BQ86SZ2 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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TRAPPC6BQ86SZ2 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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