Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2Q1Q7Z7E8 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms