Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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