Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms