Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms