Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms