Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ09

SPANXN3, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N3, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN3Q5MJ09 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPANXN3Q5MJ09 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms