Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms