Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms