Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms