Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms