Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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