Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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SYPL1Q16563 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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SYPL1Q16563 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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SYPL1Q16563 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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SYPL1Q16563 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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SYPL1Q16563 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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SYPL1Q16563 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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