Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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SNAPC1Q16533 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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SNAPC1Q16533 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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SNAPC1Q16533 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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SNAPC1Q16533 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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SNAPC1Q16533 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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SNAPC1Q16533 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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SNAPC1Q16533 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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