Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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