Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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