Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms