Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms