Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms