Protein–RNA interactions for Protein: Q14957

GRIN2C, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2CQ14957 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIN2CQ14957 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIN2CQ14957 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIN2CQ14957 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIN2CQ14957 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIN2CQ14957 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIN2CQ14957 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIN2CQ14957 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIN2CQ14957 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIN2CQ14957 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIN2CQ14957 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIN2CQ14957 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIN2CQ14957 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIN2CQ14957 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIN2CQ14957 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIN2CQ14957 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIN2CQ14957 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIN2CQ14957 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIN2CQ14957 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIN2CQ14957 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIN2CQ14957 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIN2CQ14957 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIN2CQ14957 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIN2CQ14957 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIN2CQ14957 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIN2CQ14957 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIN2CQ14957 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIN2CQ14957 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIN2CQ14957 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIN2CQ14957 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms