Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
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SHROOM2Q13796 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
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