Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
APOFQ13790 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
APOFQ13790 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
APOFQ13790 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
APOFQ13790 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
APOFQ13790 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
APOFQ13790 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
APOFQ13790 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
APOFQ13790 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
APOFQ13790 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
APOFQ13790 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
APOFQ13790 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
APOFQ13790 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
APOFQ13790 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
APOFQ13790 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
APOFQ13790 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
APOFQ13790 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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APOFQ13790 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
APOFQ13790 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
APOFQ13790 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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APOFQ13790 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
APOFQ13790 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
APOFQ13790 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
APOFQ13790 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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APOFQ13790 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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APOFQ13790 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
APOFQ13790 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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APOFQ13790 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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APOFQ13790 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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APOFQ13790 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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APOFQ13790 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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APOFQ13790 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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APOFQ13790 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOFQ13790 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOFQ13790 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOFQ13790 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOFQ13790 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOFQ13790 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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