Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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