Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms