Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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