Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
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