Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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