Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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