Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms