Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 METTL23-207ENST00000588783 1184 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
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