Protein–RNA interactions for Protein: Q12840

KIF5A, Kinesin heavy chain isoform 5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF5AQ12840 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KIF5AQ12840 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms